故事起始于终于结束了自卫队特殊部队训练的夏实，还有在洛杉矶学习警察科学搜查学成归来的美幸身上。进修回来的二人，实战能力进一步提升。在飞回日本的客机上，美幸认识了一名正太，可是当客机在日本着陆时，这个正太貌似就被谁拐带走了…

小智和同伴们遇到了街头表演明星少女广美。广美是“水之民”的末裔，她能和水中的口袋怪兽交流。小智他们从广美那里听说，大海里有一座由水之民建造的“海之神殿”，里面藏着稀世珍宝“海之王冠”。这时，传说中的口袋怪兽援助员杰克突然…

故事讲述了海洋公园的15名少年偷偷地搭乘“月亮号”探险潜水艇，然后展开的探索冒险旅程，在水下探险结束返程的路上，15名少年被卷入黑洞中，后又遇到暴风雨的袭击，与另一艘海盗船发生冲突，并一同被风暴带到了一座无人的孤岛。喵星少年…

美幸和夏实分别完成一年的研修重返墨东署。跟著，区内接连发生多宗案件。 先有葵双叶和赖子发现一批数量庞大的鎗械，继而发生交通灯神秘故障以及电话线不通的意外。 后来，眾人在一次捣破走私鎗械交易的行动中发现一隻光碟，可是，其中的…

我是个科学呆子,天生没运动神经却加入网球社，还不都是因为我太喜欢真理了嘛！我甚至还制造了一个机器人，叫麻理（音同真理）！我以为这一切都能瞒天过海的，没想到真里却突然出现在网球社！天啊！当真理碰上麻理……这下糟了！

从五次元而来的邪恶军团“嘉克帝国”开始准备进攻地球了。而阻挡他们的是从古代开始就保护地球的艾鲁多兰和他所驾驶的雷神王。可是，雷神王被帝国的司令官贝路塞夫卑鄙的手段所伤，而坠落到地球…… 雷神王坠落到阳升学园里，艾鲁多兰将…